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医疗机构财务会计内部控制规定目录：
第一章 总则
第二章 预算控制
第三章 收入控制
第四章 支出控制
第五章 货币资金控制
第六章 药品及库存物资控制
第七章 固定资产控制
第八章 工程项目控制
第九章 对外投资控制
第十章 债权和债务控制
第十一章 财务电子信息化控制
第十二章 监督检查
第十三章 附则

医疗机构财务会计内部控制规定内容简介：
第一章   总则
第一条  为贯彻执行国家财经法律法规和规章制度，维护国有资产的安全与完整，堵塞管理漏洞，提高医疗机构财务管理水平和会计信息质量，依据《中华人民共和国会计法》、《中华人民共和国预算法》、财政部颁发的《内部会计控制规范》、《事业单位财务规则》、《事业单位国有资产管理暂行办法》及《医院财务制度》、《医院会计制度》等法规制度，制定本规定。
第二条  本规定适用于县级以上政府举办的各级各类医疗机构。其他医疗机构参照执行。
第三条  医疗机构负责人对本单位财务会计内部控制制度的建立和有效实施负责。医疗机构财务部门具体组织本单位财务会计内部控制制度的落实。
第二章  预算控制
第四条  建立健全预算编制、审批、执行、调整、分析、考核等管理制度。单位一切收入、支出必须全部纳入预算管理。
第五条  建立严格的预算编制制度。根据单位总体发展规划和年度事业发展计划，科学合理地编制年度预算。建立由单位领导负责，财务部门牵头，相关部门参与，分工合作的预算管理工作机制。
第六条  预算按规定程序逐级上报，由上级预算管理部门审批。
第七条  医疗机构要按照批准的年度预算组织收入、安排支出，严格控制无预算支出。
第八条  年度预算一经批复，一般不予调整。因政策变化、突发事件等客观原因影响预算执行的，按规定程序报批。
第九条  定期分析预算执行情况，及时研究预算执行中的问题，采取改进措施，确保年度预算的完成。建立预算执行绩效考评制度。